آپدیت‌های OTA یا Over The Air اندروید، روت را پاک می‌کنند و شما مجبور خواهید بود در صورت وابستگی به برنامه هایی که برای استفاده حتما نیاز به روت شدن دارند، دوباره دستگاه را روت کنید. البته راه‌هایی برای حفظ این دسترسی روت وجود دارد و روت مجدد روی برخی دستگاه‌ها به نسبت آسان‌تر خواهد شد.

این امر روی دیوایس‌های Nexus که آپدیت‌ها را به طور مستقیم از گوگل دریافت می‌کند می‌تواند بسیار آزار‌‌‌‌‌‌دهنده باشد. حال آن که بر روی یک دیوایس قدیمی که هیچ گاه آپدیت‌های اندروید را دریافت نمی‌کند این به ذهن هم نمی‌آید.